برای اینکه در زمان نگهداری، خواص و همچنین عطر زعفران از بین نرود، پیشنهاد می‌شود از ظروف فلزی یا شیشه‌ای تیره رنگ برای نگهداری از آن استفاده کنید.

اول اینکه هیچ‌گاه زعفران یا ظرف آن را در مقابل تابش مستقیم نور آفتاب قرار ندهید، زیرا این امر باعث می‌شود عطر و طعم زعفران پس از مدتی از بین برود. همچنین در نظر بگیرید که نگهداری زعفران در مجاورت با هوای گرم باعث کاهش ترکیبات موثر زعفران می شود لذا پیشنهاد می‌شود حتی الامکان زعفران در فضای خشک و خنک نگهداری گردد؛ همچنین توصیه می‌شود که زعفران را به میزان مورد نیاز در هربار از مصرف آسیاب نموده و مورد استفاده قرار دهید.

بدون استفاده از قند و شکر آسیاب کنید و نکته قابل توجه این است سعی کنید به اندازه میزان مصرف در هر نوبت آسیاب شود.

بله، در صورتی که از مدت زمان برداشت زعفران مدت زمانی طولانی گذشته باشد، کیفیت زعفران به شدت افت کرده و سبب فاسد شدن آن می‌شود. شرکت سحرخیز سعی کرده است با کاهش فاصله زمانی برداشت زعفران از زمین کشاورزی تا به دست مصرف‌‌کننده رساندن زعفران، مدت زمان نگهداری زعفران را افزایش دهد.

با قرار دادن یخ بر روی زعفران دم کرده می‌توان شوک خوبی به آن وارد کرده و عطر و رنگ بیشتری از زعفران بدست آورد.

نگهداری طولانی مدت زعفران دم کرده اصلا توصیه نمی‌شود و بهتر است در هر وعده غذایی با توجه به میزان زعفران مورد نیاز، زعفران دم شده و بلافاصله استفاده گردد تا از میزان کیفیت زعفران کاسته نشود.

رعایت تعادل در مصرف هرگونه ماده غذایی می بایست مدنظر قرار گیرد؛ لذا مصرف زعفران در مقادیر بالا همانند سایر ترکیبات غذایی قطعا سبب بروز مشکلاتی برای مصرف کننده ایجاد خواهد کرد؛ مطالعات نشان داده اند تماس و استنشاق گرده گیاه زعفران میتواند تنها در برخی از افراد باعث ایجاد واکنش‌های آلرژیک که عمدتاً در چشم ، بینی و سیستم تنفسی فوقانی بروز می کنند.
برخی از عوارض جانبی رایج حساسیت غذایی زعفران شامل موارد زیر می‌شود:
سردرد، اضطراب، سرگیجه، آلرژی پوست، خشکی دهان، عدم اشتها، ناراحتی معده، حالت تهوع، کاهش وزن.

مصرف زعفران در دوران بارداری قطعا می‌بایست با توصیه پزشک مربوطه صورت گیرد.